Tartuntatautilain mukaisesti infektioiden torjuntayksikkö ohjaa hoitoon liittyvien infektioiden ja moniresistenttien mikrobien seurantaa ja torjuntaa, sekä epidemioiden selvittämistä ja torjuntaa Pirkanmaan alueella. Infektioiden torjuntayksikkö ylläpitää alueellista infektiotautien torjunnan ja hoidon ohjeistusta, neuvoo ja kouluttaa sosiaali- ja terveydenhuollon toimijoita infektioiden torjunnassa ja hoidossa, sekä tiedottaa väestölle infektioista ja tartuntataudeista. Infektioiden torjuntayksikössä työskentelee infektiolääkäreitä ja hygieniahoitajia.