Tampereen Biopankin tutkimusprojektit 2025

Extracellular vesicle based prediction of suicide (pilot project)

Edwin van den Oord, Virginia Commonwealth University

Yli 700 000 ihmistä maailmassa kuolee vuosittain itsemurhiin ja jokaisella itsemurhalla on syvällinen vaikutus suureen sukulaisten ja ystävien joukkoon. Nykyiset menetelmät itsemurhayritysten ennustamiseen eivät ole tarkkoja, joten on mahdotonta tunnistaa ihmisiä, jotka ovat vaarassa yrittää itsemurhaa. Tämän projektin päätavoitteena on löytää uusia tehokkaita, aivosolujen verenkiertoon vapauttavia markkereita, jotka parantavat ennustetta ja joita kliinikot voivat käyttää itsemurhien estämiseen.

Genetic and Behavioral Factors for Smoking and Suicide

Lloyd Balbuena, University of Saskatchewan

This project will pursue methodological and substantive aims. The methodological aims will compare two types of mediation models to understand what happens if their assumptions are violated. We will then apply these models to FinnGen phenotypes and genomes to examine how smoking behaviors, mental health diagnoses, and suicide deaths are related. We will also use FinnGen data as a reference panel for the development of statistical genetics tools to better understand how ancestral differences impact traits, and to see if using individual-level data have an added benefit over summary statistics.

Precision medicine workflows in colorectal and prostate cancer (”iCAN Tampere”)

Toni Seppälä, Pirkanmaan hyvinvointialue, Tays

iCAN Tampere -hanke keskittyy täsmälääketieteeseen peräsuoli- ja eturauhassyövän hoidossa. Tavoitteena on parantaa hoitopäätöksiä ja syöpäbiologian ymmärrystä laajan molekyyliprofiloinnin avulla. Keskeisiä tavoitteita ovat laajennetun molekyyliprofiloinnin käyttöönotto metastasoituneen syövän hoidossa, peräsuolisyövän ei-operatiivisen hoidon standardointi sekä eturauhassyövän kasvainmikroympäristön tutkiminen. Projektiin kuuluu useita monikeskustutkimuksia (EMOPRO, NORPPA1) ja edistyneitä genomisia tekniikoita (WGS, WTS, scRNA-seq). Tämä monialainen yhteistyöhanke pyrkii mullistamaan syöpähoidot, parantamaan potilastuloksia ja edistämään täsmälääketieteen kehitystä.

Genetic and biological background and follow-up of different phenotypes of coeliac disease

Teea Salmi, Pirkanmaan hyvinvointialue, Tays

Keliakian on immuunivälitteinen sairaus, johon liittyy hyvin monimuotoinen oirekirjo. Ihokeliakia on keliakian tunnetuin suolen ulkopuoleinen ilmentymismuoto, jossa gluteeni aiheuttaa keliakialle tyypillisen suolivaurion lisäksi kutisevan ja rakkuloivan ihottuman. On enenevässä määrin näyttöä siitä, että keliakian eri ilmenemismuodot poikkeavat toisistaan taudin ennusteen suhteen. Erityisesti ihokeliakiaan on todettu liittyvän vähentynyttä kuolleisuutta, sekä pienentynyttä riskiä pahanlaatuisiin sairauksiin ja muihin liitännäissairauksiin. On kuitenkin toistaiseksi epäselvää, mistä nämä erot johtuvat. Tässä tutkimuksessa pyritään kartoittamaan keliakian ilmenemismuotojen ja ennusteen yhteyttä geneettisiin, serologisiin, immunologisiin sekä mikrobiologisiin tekijöihin. Pyrkimyksenä on löytää uusia työkaluja keliakian diagnostiikkaan sekä mahdollistaa keliakiapotilaiden yksilöllisempi seuranta ja ennusteen arviointi.

Identification of gene defects causing Lynch syndrome from biobank samples and returning the information to the sample donors (RETURN study)

Toni Seppälä, Tampereen yliopisto

Tässä biopankkitutkimuksessa etsitään periytyvää syöpäoireyhtymää (Lynchin syndrooma) aiheuttavien geenivirheiden kantajia (satoja), joiden geenilöydös validoidaan ja tieto palautetaan biopankeille tuntematta näytteenantajien henkilöllisyyttä. Biopankki antaa tutkijoiden yhteystiedot ja tutkimustiedotteen näytteenantajille, jotka halutessaan osallistuvat tutkimukseen, jossa he saavat geneettistä neuvontaa ja heidät ohjataan terveydenhuollon palveluihin diagnoosin varmistamiseksi ja jatkohoitoa varten. Tutkimukseen osallistumisen sijaan yhteyttä ottavilla on mahdollisuus siirtyä lähetteellä myös suoraan terveydenhuollon palveluihin. Tutkimuksen tarkoituksena on selvittää biopankkiluovuttajien suhtautumista geenitiedon palauttamiseen sekä palauttamisen vaikutuksia.